近年来,和布克赛尔蒙古自治县始终把教育摆在优先发展的战略地位，调整创新思路，不断强化政府主导地位，大力推进义务教育均衡发展工作。目前，全县有中小学校14所，其中，完全中学3所，小学10所，九年一贯制学校1所；义务教育阶段共有专任教师763人，在校学生5606名。

该县坚持实施“科教兴县”战略，成立了以县长为组长的义务教育均衡发展工作领导小组，建立了相关制度统筹协调全县义务教育均衡发展工作。该县还成立了政府教育督导委员会，实施挂牌督学制度，建立了责任挂牌督学“周督查、月抽测、季小结、年考评”的工作机制。

近年来，该县先后投入1.6亿元，合理规划和调整学校布局，新建、改扩建农村学校，加强了教育基础设施建设。成立了教学后勤管理中心，让就学路途较远的农牧民和家庭困难子女集中寄宿；对贫困寄宿生和一般寄宿生补助生活费，切实减轻了农牧民家庭的经济负担；从2012年起，率先在全疆实行十五年免费教育；实行进城务工随迁子女入学“零门槛”。

该县坚持以提升教学质量为着力点，实施县、镇学校与乡场薄弱学校联盟捆绑，县域学校与乌市中小学结为友好学校，组织开展双语特岗教师精品课比赛，少儿双语口语比赛、送课下乡等活动，搭建交流学习平台，组织校长、书记及中层干部到内地教育发达地区进行交流学习，推进“教育文化发展年”和“教学质量提升年”活动，加快培养骨干教师的步伐。目前，全县中小学教学能手培养工作室已达7个，评选出一批地区级名师、学科带头人、骨干教师，使全县各中小学的教育教学质量明显提高。

该县重视加强各族学生“五个认同”教育。各学校以体育艺术为载体，实现民族团结校园“塔联”式活动全覆盖，让各族青少年从小玩在一起、学在一起、成长在一起。2014年，该县城关小学被国务院授予“全国民族团结进步模范集体”称号，2016年该校获得“全国民族团结进步创建活动示范学校”的荣誉。